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领事部的主要工作职能是：保护我国公民的正当权益；促进侨团和侨胞团结、合作、发展；办理本国公民护照、公证，办理本国公民和外国人认证；办理外国人赴华签证。

领事部下设四个组：领事侨务组：主要负责领事保护和侨团、侨民、华人事务；证件组：主要负责各类证明；护照签证组：主要负责本国公民护照更换、补发、延期和颁发旅行证，并办理外国人和外籍华人的赴华签证。警务组：负责与日本有关部门的工作联系，打击犯罪。